Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PBDC1Q9BVG4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PBDC1Q9BVG4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PBDC1Q9BVG4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PBDC1Q9BVG4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PBDC1Q9BVG4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PBDC1Q9BVG4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PBDC1Q9BVG4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PBDC1Q9BVG4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PBDC1Q9BVG4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PBDC1Q9BVG4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms