Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms