Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCGF1Q9BSM1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCGF1Q9BSM1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms