Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TINF2Q9BSI4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TINF2Q9BSI4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms