Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NICN1Q9BSH3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NICN1Q9BSH3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms