Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RETNLBQ9BQ08 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms