Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5SQ99766 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5SQ99766 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms