Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPAS2Q99743 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms