Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP8Q99708 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms