Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEIS3Q99687 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms