Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL13Q99616 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL13Q99616 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms