Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIK3R4Q99570 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIK3R4Q99570 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms