Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms