Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CIB3Q96Q77 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms