Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms