Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRC1Q96M27 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms