Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC17Q96LX7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC17Q96LX7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms