Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPNS2Q96L46 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPNS2Q96L46 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms