Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJD4Q96KN9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms