Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms