Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TPD52L3Q96J77 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms