Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTV1Q96GA3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTV1Q96GA3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms