Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms