Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRP36Q96EU6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRP36Q96EU6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms