Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EAF2Q96CJ1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EAF2Q96CJ1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms