Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL2Q969S2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms