Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFKQ969G6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms