Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN4Q92575 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN4Q92575 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms