Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDB2Q92466 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDB2Q92466 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms