Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSMEM1Q8WWF3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms