Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC4Q8WW27 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms