Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF4Q8WV16 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF4Q8WV16 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms