Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX29Q8TEQ0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms