Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-3Q8TAU0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms