Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLDN19Q8N6F1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLDN19Q8N6F1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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