Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms