Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMYD4Q8IYR2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms