Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNTD2Q8IXW0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNTD2Q8IXW0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms