Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLD3Q8IV08 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms