Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP1Q86WV1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms