Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIBP1Q86W92 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms