Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG9AQ7Z3C6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms