Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTF1AQ7RTS3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTF1AQ7RTS3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms