Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC9Q6ZRR7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms