Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NFXL1Q6ZNB6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFXL1Q6ZNB6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms