Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms