Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q6P435 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q6P435 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q6P435 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q6P435 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q6P435 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms