Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LETMD1Q6P1Q0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms