Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPGRIP1LQ68CZ1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RPGRIP1LQ68CZ1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms