Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOCADQ5VW36 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOCADQ5VW36 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms